考试系统的管理部门主要包括 公安机关交通管理部门和 交通运输管理部门。具体来说：

公安机关交通管理部门

负责对社会考场的场地设施、考试系统、考试工作等进行统一管理。

省级或者市级公安机关交通管理部门应当对机动车驾驶人考试管理系统、考试系统的服务器、数据库进行统一管理及运维。

交通运输管理部门

如市交通运输局、市运管中心等，负责驾培机构培训监管平台和考试系统的对接工作，以及考生账号的管理和部门分类。

这些部门共同确保考试系统的顺利运行和考生的有序管理。