考试在周二进行的原因可能包括：

习惯养成：

有观点认为，学校可能希望学生通过每周二进行考试来养成一种习惯，使学生对考试日有所期待和感觉。这种安排有助于学生逐渐适应考试节奏，从而在实际高考时能够更加从容应对。

考试时间安排：

有时候，考试日期的安排可能是按照高考的时间来进行的。如果高考在周二进行，那么学校可能会选择每周二进行考试，以便与高考时间保持一致，这对学生将来的考试是有帮助的。

考场资源限制：

科三考试的时间安排可能受到当地交通管理部门的统一安排。由于考场资源有限，可能会采取限制措施来确保考试的顺利进行。禁止在星期二进行科三考试可能是为了避免考场过度拥挤或资源分配不均的情况。

避免时间重叠：

如果允许在周二进行科三考试，可能会导致与其他考试或活动的时间冲突，影响考试的安排和考生的备考计划。因此，管理部门可能会选择避开周二进行考试，以确保所有考生都能在合适的时间参加考试。

综上所述，考试在周二进行的原因可能是多方面的，包括习惯养成、考试时间安排、考场资源限制以及避免时间重叠等。具体原因可能因学校或考试类型的不同而有所差异。