医师资格考试的组织结构如下：

国家级层面

卫生部医师资格考试委员会：负责全国医师资格考试工作。委员会下设办公室和专门委员会。

国家医学考试中心和国家中医药管理局中医师资格认证中心：负责实践技能考试和医学综合考试的命题、组织实施和业务工作。

省级层面

省级医师资格考试领导小组：负责该辖区的医师资格考试工作，包括实践技能考试和医学综合考试的组织实施。

省级卫生行政部门：牵头成立医师资格考试领导小组，并负责该辖区的医师资格考试工作。

地方层面

地市级及以下卫生行政部门：协助省级卫生行政部门开展医师资格考试的相关工作，如组织报名、资格审核等。

其他相关机构

国家医学考试中心和国家中医药管理局中医师资格认证中心：负责实践技能考试和医学综合考试的命题、组织实施和业务工作。

综上所述，医师资格考试由国家和地方卫生行政部门及专门机构共同组织和管理，确保考试的权威性和标准化。