在番茄开花结果期间遇到连续降雨，可以采取以下措施来保护番茄植株，减少损失：

搭建防雨棚：

使用木棍和塑料膜为番茄搭建防雨棚，避免雨水直接淋湿番茄果实，减少裂果和腐烂现象。

加固设施：

对于设施栽培的番茄，要及时检查并加固大棚，放下四周棚膜，防止雨水灌入棚内，增设和拉紧压膜线，提高设施的抗风雨能力。

及时采收：

对于已经成熟或刚转色的番茄果实，及时抢收回室内，避免强降雨造成裂果损失。雨停后，要及时清理和疏通田间沟渠，排干番茄地块积水，防止沤根。

合理施肥：

雨后适当增施有机肥和生物肥，为番茄根系生长提供良好的环境。同时，注意对番茄叶面补充钙、硼等微量元素。在施肥方面，可以适当增加施肥量和频率，选择叶面喷肥喷施，以快速补充植株所需的养分。

加强通风和光照：

及时开启温室或大棚的通风设施，保持空气流通，减少湿度，有助于防止病害的发生。在光照不足的情况下，可以考虑使用人工光源或增加反光材料，提供足够的光照供给。

修剪和整枝：

定期修剪和整枝，保持植株的通风性，减少病害的发生。及时摘除生长不良或无法正常生长的枝叶，避免养分供应不足造成裂果。

控制病虫害：

连绵阴雨天气容易导致病虫害滋生和传播，要及时采取预防措施，如喷洒合适的杀虫剂和杀菌剂，定期清除病虫害受害植株。

通过以上措施，可以有效减轻连续降雨对番茄开花结果的不利影响，保障番茄的健康生长和优质果实的产出。